台灣溫泉種類繁多，且溫泉泉質的分析技術已臻完善，加上目前生物科技及化妝品的學研科技純熟，可利用溫泉中不同泉質成份之特點，開發最符合時代潮流的溫泉保養品 ，如此 ，有助於提升溫泉資源的附加價值，創造具特色之台灣溫泉專屬產品。

以生物技術應用角度開發溫泉之特色原料，如溫泉中之耐熱酵素（Thermophiles enzyme）為近來最受囑目的特色原料，此類耐熱酵素係由耐熱菌〔Thermophiles〕所產生，耐熱菌又稱高溫細菌或耐熱微生物，其研究已超過40年，自1969年科學家從黃石公園的溫泉裡採集到Thermus aquaticus菌種，並應用於聚合酪連鎖反應 (Polymerase chain reaction,PCR), PCR乃是利用Thermus aquaticus 菌之酵素的耐熱特性，純化進行複製基因的耐熱酵素，此酵素在生物科技上扮演重要角色，每年該酵素與PCR相關周邊市場供應產值已超過十億元。耐熱菌包含放射菌和芽孢桿菌 (Bacillus) 等好熱的菌種，其廣泛分布於火山地 、地熱區 、海底火山附近 、溫泉、等 ，而有些人為的高溫環境 ，如熱水管裝置和人造熱源等處，亦為其生長的良好環境。耐熱菌能在溫度高於55℃生長，最低生長溫度通常在45℃左右，而最適生長溫度在55～65℃ ﹔一般來說 ，其生長溫度為 45～65℃或以上 ，其特徵有代謝快速、觸酶反應溫度高及繼代時間短等，在生物技術領域及工業上有很高的利用價值。

耐熱菌產生的各種耐熱酵素，具有異於一般蛋白的穩定性，如熱穩定性（Thermostability） 、較長的保存期限（Longer shelf life）及高溫活性（Higher activity at high temperature），故能延長酵素的活性。

另外，法國生化學家利用嗜熱菌及其代謝產物研發系列化妝保養品（碧兒泉BIOTHERM），能夠幫助肌膚對抗自由基的傷害 、增強自體防禦力 ，此為另一個成功將高溫酵素應用於產業之實例 。

台灣地區地熱溫泉區曾被分離鑑定之菌種包含革蘭氏陽性的Bacillus 、Geobacillus 、 Rubrobacter Deinococcus 、Caloramator 及 Thermobrachium 等菌屬 ﹔及革蘭氏陰性的細菌 ，包含 Thermus、Meiothermus 、Chloroflexus 、Rhodothermus 、及 Pseudoxanthomonas 等屬 。有些菌株具澱粉水解酵素活性，有些菌株則具蛋白酶活性或脂質水解活性，甚至也有具抵抗高紫外線及輻射線的菌株，地熱溫泉區細菌為了應付及適應高溫之極端環境，常會發展出特異的生理特性，特別是耐熱酵素。

耐熱菌之蛋白質的熱穩定性是其生活於高溫下之特性，目前科學家已從耐熱菌中分離出多種蛋白質，其中包括許多重要的酵素系統﹔其熱穩定性遠高於一般細菌的酵素系統。在發酵工業中，可利用其耐高溫的特性，提高反應溫度，增大反應速度，減少中溫型雜菌污染的機會。耐熱菌可用於生產多種酶製劑，例如纖維素酶 、蛋白酶 、澱粉酶 、脂肪酶 、菊糖酶等 ，由這些微生物中產生的酶製劑具有熱穩定性好 、催化反應速率高 ，易於在室溫下保存 。

耐熱菌在化妝品之開發應用已有著廣闊的前景，雖然溫泉酵素廣泛應用於許多領域，然而在化妝品之應用仍是相當新穎之概念，近年來，國際溫泉更趨向於發展醫學美容的應用領域，尤其以法國的溫泉醫學美容研究最為深入，包括薇姿（Vichy） 、理膚寶水（La Roche-posay） 、雅漾（Avene）、優雅麗（Uriage）、聖泉薇（Saint Gervais）等五大品牌，長期針對溫泉醫學美容進行科學研究，並證實當地或該品牌之溫泉具有舒緩 、消炎 、促進傷口癒合等作用 ，對皮膚之保護真療效 。